В настоящее время в геологическом музее хранятся многочисленные коллекции:
- казанской школы геологов:
А.А.Штукенберг - "Фауна каменноугольных отложений Самарской Луки"
П.И. Кротов - "Геологические исследования на западном склоне Урала"
М.Э. Ноинский - "Фауна Самарской Луки", "Фауна Приказанского района" и др.
- коллекция метеоритов
- коллекция кристаллов минералов и их синтетических аналогов (самородные элементы; сульфиды и их аналоги; галогениды; оксиды и гидроооксиды; карбонаты; сульфаты; хроматы, молибдаты и вольфраматы; фосфаты, арсенаты и ванадаты; бораты; силикаты)
- коллекция ложных кристаллов (псевдоморфоз)
- тематические региональные коллекции
- коллекция самоцветов и изделий из них
- коллекция рыб
и многие другие